刘云鹏

刘云鹏，男，农学博士，博士生导师。中国农业科学院农业资源与农业区划研究所研究员，农业微生物资源创新团队骨干。主要从事根际微生物-植物互作研究，在根际有益芽孢杆菌定殖机理、促生/生防/增强植物耐盐机理、根际微生物群落调控等方面取得重要进展。主持国家自然科学基金等项目3项，以第一或通讯作者在Nature Microbiology、Nature Communications、FEMS Microbiology Reviews、Microbiome、New Phytologist、Horticulture Research、Plant Cell & Environment等期刊发表论文20余篇。

教育背景

2007-2011 南京农业大学 理学学士

2011-2015 南京农业大学 农学博士

工作经历

2015-2018 中国农业科学院农业资源与农业区划研究所 助理研究员 博士后

2018-2019 中国农业科学院农业资源与农业区划研究所 副研究员 博士后

2019-2023 中国农业科学院农业资源与农业区划研究所 副研究员

2023至今 中国农业科学院农业资源与农业区划研究所 研究员

主持项目

1、国家自然科学基金面上项目，2024-01-01至2027-12-31，贝莱斯芽孢杆菌VII型分泌系统分泌蛋白YukE介导的根系铁泄漏促进其根际定殖的机制研究， 50万元，主持

2、国家自然科学基金面上项目，2021-01-01至2024-12-31，植物益生解淀粉芽孢杆菌VII型分泌系统影响根际定殖的机理研究， 58万元，主持

3、国家自然科学基金青年项目，2017-01-01至2019-12-31，根际促生解淀粉芽孢杆菌SQR9组氨酸激酶KinA-E响应的根系分泌物信号鉴定，20万元，主持

4、中国农业科学院青年创新专项，2021-01-01至2024-12-31，根际益生贝莱斯芽孢杆菌SQR9抑制根系局部免疫并高效定殖的分子机理研，150万，主持

获奖成果

2022年度江苏省科学技术奖，优异功能菌选育与微生物肥料创制，二等，第五

代表性论文

Liu, Y.#*, Shu, X. #, Chen, L. #, Zhang, H., Feng, H., Sun, X., Xiong, Q., Li, G., Xun, W., Xu, Z., Zhang, N., Pieterse, C. M. J., Shen, Q., and Zhang, R. * 2023. Plant commensal type VII secretion system causes iron leakage from roots to promote colonization. Nature Microbiology 8:1434–1449

Liu, Y.#, Zhang, H. #, Wang, J., Gao, W., Sun, X., Xiong, Q., Shu, X., Miao, Y., Shen, Q., Xun, W. *, and Zhang, R. * 2024. Nonpathogenic Pseudomonas syringae derivatives and its metabolites trigger the plant “cry for help” response to assemble disease suppressing and growth promoting rhizomicrobiome. Nature Communications 15:1907

Liu, Y.#, Xu, Z. #, Chen, L., Xun, W., Shu, X., Chen, Y., Sun, X., Wang, Z., Ren, Y., Shen, Q., and Zhang, R. * 2024. Root colonization by beneficial rhizobacteria. FEMS Microbiology Reviews. 48:1–20

Xun, W. #, Liu, Y.#, Li, W., Ren, Y., Xiong, W., Xu, Z., Zhang, N., Miao, Y., Shen, Q., and Zhang, R. * 2021. Specialized metabolic functions of keystone taxa sustain soil microbiome stability. Microbiome 9:35

Xun, W. #, Liu, Y.#, Ma, A., Yan, H., Miao, Y., Shao, J., Zhang, N., Xu, Z., Shen, Q., and Zhang, R. * 2024. Dissection of rhizosphere microbiome and exploiting strategies for sustainable agriculture. New Phytologist 242:2401-2410

Chen, L., Bian, L., Ma, Q., Li, Y., Wang, X., and Liu, Y.* 2024. Defensive alteration of root exudate composition by grafting Prunus sp. onto resistant rootstock contributes to reducing crown gall disease. Horticulture Research 11:26–28

Zhang, H., Liu, Y.*, Wu, G., Dong, X., Xiong, Q., Chen, L., Xu, Z., Feng, H., and Zhang, R. * 2021. Bacillus velezensis tolerance to the induced oxidative stress in root colonization contributed by the two-component regulatory system sensor ResE. Plant Cell & Environment 44:3094–3102

Dong, X., Tu, C., Liu, Y., Zhang, R., and Liu, Y.* 2022. Identification of the core c-di-GMP turnover proteins responsible for root colonization of Bacillus velezensis. iScience 25:105294

Liu, Y., Xun, W., Chen, L., Xu, Z., Zhang, N., Feng, H., Zhang, Q., and Zhang, R. * 2022. Rhizosphere microbes enhance plant salt tolerance: Toward crop production in saline soil. Computational and Structural Biotechnology Journal. 20:6543–6551

Liu, Y.#, Feng, H. #, Chen, L., Zhang, H., Dong, X., Xiong, Q., and Zhang, R. * 2020. Root-secreted spermine binds to Bacillus amyloliquefaciens SQR9 histidine kinase KinD and modulates biofilm formation. Molecular Plant-Microbe Interactions 33:423–432

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